MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bacillus thuringiensis HD-789 plasmid p05

Total Repeats: 180

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018511	T	6	6	4	9	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018511	A	7	7	60	66	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018511	TAAAA	2	10	67	76	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018511	A	6	6	212	217	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018511	T	6	6	258	263	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018511	TA	4	8	334	341	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018511	GAA	2	6	361	366	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018511	A	6	6	384	389	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018511	A	8	8	395	402	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018511	AAT	3	9	409	417	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018511	ATAA	2	8	429	436	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018511	TGA	2	6	470	475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434379792
13	NC_018511	CCA	2	6	507	512	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	434379792
14	NC_018511	ATA	2	6	529	534	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434379792
15	NC_018511	TAT	2	6	538	543	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434379792
16	NC_018511	AAAG	2	8	567	574	75 %	0 %	25 %	0 %	434379792
17	NC_018511	TTCT	2	8	781	788	0 %	75 %	0 %	25 %	434379792
18	NC_018511	GGT	2	6	840	845	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	434379792
19	NC_018511	TGG	2	6	884	889	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	434379792
20	NC_018511	AGG	2	6	992	997	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	434379792
21	NC_018511	CTG	2	6	1105	1110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434379792
22	NC_018511	CTG	2	6	1147	1152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434379792
23	NC_018511	AGG	2	6	1310	1315	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	434379792
24	NC_018511	CAG	2	6	1390	1395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434379792
25	NC_018511	CAG	2	6	1438	1443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434379792
26	NC_018511	AGG	2	6	1502	1507	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	434379792
27	NC_018511	GGGAA	2	10	1518	1527	40 %	0 %	60 %	0 %	434379792
28	NC_018511	TTA	2	6	1548	1553	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434379792
29	NC_018511	T	7	7	1577	1583	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018511	AATT	2	8	1596	1603	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018511	ATAC	2	8	1610	1617	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_018511	T	6	6	1675	1680	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018511	AGA	3	9	1711	1719	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018511	A	7	7	1789	1795	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018511	GAA	2	6	1796	1801	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018511	A	6	6	1907	1912	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018511	ATA	2	6	1947	1952	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018511	TTG	2	6	1999	2004	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018511	CTTTA	2	10	2029	2038	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
40	NC_018511	CAA	2	6	2050	2055	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_018511	T	6	6	2088	2093	0 %	100 %	0 %	0 %	434379793
42	NC_018511	A	7	7	2105	2111	100 %	0 %	0 %	0 %	434379793
43	NC_018511	A	8	8	2119	2126	100 %	0 %	0 %	0 %	434379793
44	NC_018511	ATT	2	6	2264	2269	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434379793
45	NC_018511	GAAA	2	8	2288	2295	75 %	0 %	25 %	0 %	434379793
46	NC_018511	A	6	6	2293	2298	100 %	0 %	0 %	0 %	434379793
47	NC_018511	ATG	2	6	2401	2406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434379793
48	NC_018511	ATTG	2	8	2409	2416	25 %	50 %	25 %	0 %	434379793
49	NC_018511	CAG	2	6	2434	2439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434379793
50	NC_018511	CAG	2	6	2446	2451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434379793
51	NC_018511	CTT	2	6	2453	2458	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434379793
52	NC_018511	TCT	2	6	2471	2476	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434379793
53	NC_018511	A	6	6	2492	2497	100 %	0 %	0 %	0 %	434379793
54	NC_018511	A	6	6	2507	2512	100 %	0 %	0 %	0 %	434379793
55	NC_018511	TAA	2	6	2548	2553	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018511	A	6	6	2563	2568	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018511	T	7	7	2596	2602	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018511	T	7	7	2657	2663	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018511	GCTG	2	8	2713	2720	0 %	25 %	50 %	25 %	434379794
60	NC_018511	TGG	2	6	2796	2801	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	434379794
61	NC_018511	A	6	6	2888	2893	100 %	0 %	0 %	0 %	434379794
62	NC_018511	AAAAG	2	10	2914	2923	80 %	0 %	20 %	0 %	434379794
63	NC_018511	TA	4	8	3034	3041	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018511	GAA	2	6	3061	3066	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018511	AAT	2	6	3071	3076	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018511	A	8	8	3105	3112	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018511	A	8	8	3127	3134	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018511	A	7	7	3144	3150	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018511	A	8	8	3164	3171	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018511	ATAA	2	8	3203	3210	75 %	25 %	0 %	0 %	434379795
71	NC_018511	T	6	6	3225	3230	0 %	100 %	0 %	0 %	434379795
72	NC_018511	AAC	2	6	3314	3319	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434379795
73	NC_018511	T	6	6	3412	3417	0 %	100 %	0 %	0 %	434379795
74	NC_018511	ATT	2	6	3495	3500	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434379795
75	NC_018511	A	6	6	3559	3564	100 %	0 %	0 %	0 %	434379795
76	NC_018511	CTT	2	6	3566	3571	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434379795
77	NC_018511	TAC	2	6	3575	3580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434379795
78	NC_018511	TAT	2	6	3611	3616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434379795
79	NC_018511	T	6	6	3654	3659	0 %	100 %	0 %	0 %	434379795
80	NC_018511	TTC	2	6	3678	3683	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434379795
81	NC_018511	CCA	2	6	3685	3690	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	434379795
82	NC_018511	TCT	3	9	3727	3735	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434379795
83	NC_018511	CCA	2	6	3742	3747	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	434379795
84	NC_018511	T	8	8	3798	3805	0 %	100 %	0 %	0 %	434379795
85	NC_018511	TC	3	6	3845	3850	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_018511	GGAA	2	8	3858	3865	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018511	TA	3	6	3888	3893	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018511	AT	3	6	3898	3903	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018511	TTA	2	6	3919	3924	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018511	TA	3	6	3982	3987	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018511	TGT	2	6	4001	4006	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018511	ATT	2	6	4048	4053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018511	ATCT	2	8	4056	4063	25 %	50 %	0 %	25 %	434379796
94	NC_018511	CTT	2	6	4097	4102	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434379796
95	NC_018511	TC	3	6	4159	4164	0 %	50 %	0 %	50 %	434379796
96	NC_018511	T	6	6	4193	4198	0 %	100 %	0 %	0 %	434379796
97	NC_018511	CTT	2	6	4285	4290	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434379796
98	NC_018511	ACTT	2	8	4297	4304	25 %	50 %	0 %	25 %	434379796
99	NC_018511	T	6	6	4303	4308	0 %	100 %	0 %	0 %	434379796
100	NC_018511	TTTC	2	8	4327	4334	0 %	75 %	0 %	25 %	434379796
101	NC_018511	T	6	6	4409	4414	0 %	100 %	0 %	0 %	434379796
102	NC_018511	AAT	2	6	4415	4420	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434379796
103	NC_018511	T	7	7	4436	4442	0 %	100 %	0 %	0 %	434379796
104	NC_018511	TTC	2	6	4491	4496	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434379796
105	NC_018511	CTA	3	9	4534	4542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434379796
106	NC_018511	CTT	2	6	4543	4548	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434379796
107	NC_018511	T	6	6	4630	4635	0 %	100 %	0 %	0 %	434379796
108	NC_018511	TTG	2	6	4691	4696	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434379796
109	NC_018511	TAC	2	6	4700	4705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434379796
110	NC_018511	CAA	2	6	4726	4731	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434379796
111	NC_018511	CTAATT	2	12	4756	4767	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	434379796
112	NC_018511	GTTT	2	8	4769	4776	0 %	75 %	25 %	0 %	434379796
113	NC_018511	T	6	6	4788	4793	0 %	100 %	0 %	0 %	434379796
114	NC_018511	AATC	2	8	4801	4808	50 %	25 %	0 %	25 %	434379796
115	NC_018511	TTTCTT	2	12	4822	4833	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	434379796
116	NC_018511	TC	3	6	4977	4982	0 %	50 %	0 %	50 %	434379796
117	NC_018511	TTG	2	6	5021	5026	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434379796
118	NC_018511	TCA	3	9	5118	5126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434379796
119	NC_018511	TC	3	6	5162	5167	0 %	50 %	0 %	50 %	434379796
120	NC_018511	CTT	2	6	5197	5202	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434379796
121	NC_018511	T	6	6	5201	5206	0 %	100 %	0 %	0 %	434379796
122	NC_018511	GTC	2	6	5225	5230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434379796
123	NC_018511	ATC	2	6	5279	5284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434379796
124	NC_018511	TAG	2	6	5301	5306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434379796
125	NC_018511	TCA	2	6	5307	5312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434379796
126	NC_018511	CTT	2	6	5359	5364	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434379796
127	NC_018511	AAAT	2	8	5406	5413	75 %	25 %	0 %	0 %	434379796
128	NC_018511	TAT	3	9	5467	5475	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434379796
129	NC_018511	TGA	2	6	5490	5495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434379796
130	NC_018511	GATT	2	8	5496	5503	25 %	50 %	25 %	0 %	434379796
131	NC_018511	CCA	2	6	5531	5536	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
132	NC_018511	CGA	2	6	5575	5580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_018511	ATG	2	6	5582	5587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_018511	T	6	6	5907	5912	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_018511	T	6	6	5939	5944	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_018511	AT	3	6	5949	5954	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_018511	GTG	2	6	5973	5978	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
138	NC_018511	TGA	2	6	6065	6070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434379797
139	NC_018511	AT	3	6	6114	6119	50 %	50 %	0 %	0 %	434379797
140	NC_018511	TTG	2	6	6127	6132	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434379797
141	NC_018511	CAT	2	6	6174	6179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434379797
142	NC_018511	TTA	2	6	6187	6192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434379797
143	NC_018511	CATA	2	8	6219	6226	50 %	25 %	0 %	25 %	434379797
144	NC_018511	A	6	6	6226	6231	100 %	0 %	0 %	0 %	434379797
145	NC_018511	TAT	2	6	6299	6304	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_018511	ATTTT	2	10	6437	6446	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_018511	T	6	6	6443	6448	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_018511	TGA	2	6	6529	6534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
149	NC_018511	TTTG	2	8	6588	6595	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
150	NC_018511	TCA	2	6	6609	6614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
151	NC_018511	GTT	2	6	6626	6631	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
152	NC_018511	ATG	2	6	6638	6643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
153	NC_018511	T	6	6	6674	6679	0 %	100 %	0 %	0 %	434379798
154	NC_018511	ATA	2	6	6688	6693	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434379798
155	NC_018511	TA	3	6	6740	6745	50 %	50 %	0 %	0 %	434379798
156	NC_018511	AAT	2	6	6781	6786	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434379798
157	NC_018511	TTTAAT	2	12	6826	6837	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434379798
158	NC_018511	TGA	2	6	6889	6894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434379798
159	NC_018511	AT	3	6	6898	6903	50 %	50 %	0 %	0 %	434379798
160	NC_018511	CAC	2	6	6912	6917	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	434379798
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171	NC_018511	TAT	2	6	7211	7216	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
172	NC_018511	T	6	6	7216	7221	0 %	100 %	0 %	0 %	434379799
173	NC_018511	CTT	2	6	7245	7250	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434379799
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179	NC_018511	ATAC	2	8	7607	7614	50 %	25 %	0 %	25 %	434379799
180	NC_018511	TTA	2	6	7625	7630	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.